本門本尊

　　「本尊」就是因其為根本而尊敬之的意思。任何宗教都有其信仰的根本，因此，以甚麼作為本尊是一個非常重要的問題。本門本尊是具體地將一切萬物的究極表現，從根本上使一切人獲得幸福的，最優越的本尊。

　　「本門」一般是指釋尊所說法華經二十八品裡，其中後半的十四品。這是說明釋尊最高的領悟——一念三千法門的部分。釋尊在這本門中說明了自己在久遠的往昔經已成道，可是他並沒有說明成佛根源的法。雖然文面沒有說明，但日蓮大聖人是第一個將秘沉於本門壽量品文底的大法顯現出來。所以，大聖人的法門稱為文底獨一本門。

　　本門本尊是本佛日蓮大聖人以生命書寫而顯現出來的，那裡是實現貫穿宇宙與生命根源之法的南無妙法蓮華經。這個本門本尊正是在末法今時，令一切眾生成佛，得到根本幸福境涯的最優勝的本尊。

　　還有，在〈覆日女書〉中有：「在這，日蓮是多麼的不可思議。龍樹、天親等，天台、妙樂等也未能顯現大曼荼羅，進入末法，經過二百餘年的這個時候，竟然能夠由日蓮開始顯現出《法華經》弘通的旗印來。」（日文御書全集一二四三頁）由此可見，日蓮大聖人圖顯御本尊是大聖人出現之前，從未有人顯現過的本尊。

人本尊與法本尊

　　這個本門本尊是人、法兩面的。

　　所謂人本尊，是令末法的一切眾生成佛，與久遠元初妙法為一體的佛（久遠元初自受用報身如來），即是末法本佛的日蓮大聖人。

　　所謂法本尊，是以人本尊的生命圖顯出來曼荼羅的本尊。而有關它的相貌，是在中央有「南無妙法蓮華經　日蓮」，兩邊則有由地獄界至佛界這十界眾生的配合。顯示出在大聖人的己心之中亦具有十界，即開示出一念三千之法。因為這是大聖人的生命，是作為一念三千的當體真實地顯現出來的，所以亦名為「事的一念三千」。

　　大聖人有說：「這個御本尊是日蓮將魂魄染於墨而寫成的，你要相信啊！」（〈覆經王書〉，日文御書全集一一二四頁）人本尊的日蓮大聖人與法本尊的大曼荼羅是一體的，這個名為「人法一箇」。